quarta-feira, 14 de novembro de 2012

Real Time PCR

 
    
Técnica de amplificação in vitro que pode amplificar sequências especiíficas de DNA intacto ou fragmentado.
Baseia-se em um ciclo repetitivo de três reações, desnaturação, anelamento e amplificação do DNA, que ocorrem em diferentes temperaturas.
Desnaturação: temperatura aprox. 94ºC. Separação da dupla fita de DNA pelo rompimento das pontes de hidrogênio.
Anelamento: temperatura aprox. 54ºC. Ligação do primers foward e reverse às fitas de DNA.
Amplificação: temperatura aprox. 60 – 70 ºC. Ligação da Taq DNA polimerase e extensão das fitas de DNA pela adição de nucleotídeos nas extremidades 5’ livres.
Para o sequenciamento os dideoxinucleotídios marcados com fluoróforos são detectados ao término de cada ciclo.
A PCR tempo real requer um termociclador com um sistema óptico para a excitação da fluorescência e um computador para coleta e análise de dados.
A partir deste método, a quantificação de DNA ou RNA pode ser feita de maneira mais precisa e com maior reprodutibilidade.

KITS

SYBR® Green se liga entre as fitas duplas de DNA.
Vantagens: baixo custo, facilidade de uso e sensibilidade.
Desvantagens: inespecífico para o fragmento alvo, pois liga-se em toda região pareada.

TaqMan ® é um método sensível que consiste em determinar presença ou ausência de sequências específicas.
É uma sonda que se liga na região alvo do DNA fita simples que contém uma extremidade fluorescente (F) e um extremidade quencher (Q).
Quando a polimerase sintetiza a segunda fita, quebra essa sonda liberando a fluorescência.







Referência
                www.biotecnologia.com.br/revista/bio33/pcr.pdf



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